Sunday, July 1, 2018

Técnica de edición genomica para cáncer gástrico

CRISPR contra el cáncer 

CRISPR no es una terapia en sí misma. Es una herramienta. Pero debido a su precisión, los investigadores esperan que sea capaz de realizar ediciones genéticas que sean más efectivas que las técnicas tradicionales de edición de genes, para activar el sistema inmune de un paciente para matar las células cancerosas.
Para realizarlo, recolectarán un tipo de célula inmune, conocida como células T, de la sangre de un paciente y luego usarán CRISPR para manipular un gen particular de una manera que  activará las  células T  para atacar las células cancerosas. Y luego volverán a poner las células CRISPR-ed en el cuerpo del paciente para destruir los tumores. 
Los experimentos para alterar genéticamente las células y reprogramar el sistema inmune son intrínsecamente arriesgados. Existe el peligro de desencadenar una respuesta inmune catastrófica conocida como tormenta de citoquinas que puede abatir fatalmente al cuerpo. Y al liberar las células T contra el cáncer, también es posible que comiencen a atacar el tejido normal también. 


Fuentes:

Sunday, June 24, 2018

Stem cells en el cáncer gástrico

Los tumores contienen células cancerosas heterogéneos fenotípicamente y funcionalmente que son capaces de mantener el crecimiento a largo plazo del tumor, recurrencia tumoral y la apoptosis y la resistencia a la quimioterapia. La inflamación crónica debido a la infección por H.pylori juega un papel importante en la transformación de células madre residentes en las células tumorales.
Nuevos tratamientos asociados a Stem Cells incluyen: terapias dirigidas GCSC (Gastric cancer stem cells) que han sido identificadas por moléculas de superficie celular CD44-FITC; y la inhibición de las vías de GCSC; con el fin de destruir a estas GCSC alteradas y luego insertar otras CGSC que han sido cultivadas a partir de otros tejidos de la misma persona.


Fuente:

Shree Ram Singh. Gastric cancer stem cells: A novel therapeutic target. Cancer Lett. 2013 September 10; 338(1): 110–119. doi:10.1016/j.canlet.2013.03.035. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3755024/pdf/nihms469523.pdf

Saturday, June 16, 2018

ADN recombinante en la naturaleza y artificial

ADN recombinante en la naturaleza

El DAN se recombina de forma natural mediante procesos como la reproducción sexual, la transformación bacteriana y la infección viral.  En el caso de las bacterias, como el Helicobacter pylori la transformación le permite capturar DAN libre que puede ser parte del cromosoma de otra bacteria, incluso de otra especie bacteriana; también puede haber transformación cuando capturan diminutas moléculas de DAN llamadas plásmidos, los cuales le permiten a las bacterias crecer en ambientes nuevos; un claro ejemplo de esto lo encontramos en las bacterias que tienen plásmidos resistentes a antibióticos. 

ADN recombinante artificial para el Cancer Gastrico

La tecnología del ADN recombinante, se basa en incorporar el gen humano de una proteína conocida, a través de una molécula de ADN artificial formada in vitro, a una célula hospedera. Se usa básicamente para la obtención de anticuerpos monoclonales. Las citoquinas más usadas como tratamiento directo del cáncer son:
  • El Interferón alfa: son producidas por distintas células e incluyen un rango amplio de actividades biológicas, como son: la inducción de resistencia celular a virus, regulación de la función inmune, regulación del crecimiento y diferenciación de muchos tipos celulares.
  • La Interleuquina 2: induce la actividad biológica a través de un receptor específico de membrana, el cual se encuentra frecuentemente expresado en las células inmunes, ya que juega un rol central en la respuesta inmune, como consecuencia de la activación antigénica.

Esto ha permitido el desarrollo de anticuerpos quiméricos (chAb), anticuerpos humanizados (hzAb), y más recientemente, anticuerpos monoclonales completamente humanos o fully human (fhAb). 

Fuentes:

Saturday, June 9, 2018

Prueba de microarray para cáncer gástrico


Tema: Identificación de biomarcadores sanguíneos para la detección de lesiones premalignas y el diagnóstico del cáncer gástrico.

Objetivos: el objetivo de este trabajo es identificar marcadores moleculares (perfil de expresión de ARNm) que distingan a los pacientes con condiciones premalignas (atrofia, metaplasia) y cáncer gástrico, de aquellos pacientes que solo tienen gastritis.

Metodología: se tomaron pacientes en cada una de las etapas de la cascada de Correa, los cuales proporcionaron una muestra, previo consentimiento firmado, de 2,5 mL de sangre en ayunas para el análisis de expresión de genes tomadas después de la endoscopia inicial. La sangre se colocó en un tubo de ARN sanguíneo PAXgene; luego, el ARN se extrajo de la sangre y se analizó usando una plataforma de microarrays, los cuales identificaron cambios de expresión de ARN mensajero que permitieron diferenciar cada una de las etapas descritas.

Resultados: se incluyeron 89 pacientes, y en los hallazgos endoscópicos se encontró gastritis crónica antral en 27 pacientes (30,3%), cáncer gástrico avanzado en 25 (28%), pangastritis crónica en 15 (16,8%), cáncer temprano en 7 (7,8%), sospecha de metaplasia intestinal en 6 (6,7%), sospecha de gastritis atrófica en 3 (3,3%) y úlcera péptica en 2 casos (2,2%). Cuando se revisó el informe patológico se halló gastritis crónica en 34 pacientes (22 mujeres), adenocarcinoma intestinal en 20 (4 mujeres), metaplasia intestinal 18 casos (13 mujeres), cáncer tipo difuso en 11 (7 mujeres), displasia de bajo grado en 4 y de alto grado en 1, y atrofia sola en 1 paciente. En el análisis de expresión genética se encontraron 48 genes que permitieron determinar a los pacientes con gastritis crónica de aquellos con cáncer gástrico. También se hallaron 14 genes para diferenciar los pacientes con cáncer difuso de los de tipo intestinal, y un grupo de 48 genes que ayudó a distinguir los pacientes con gastritis crónica de los de metaplasia intestinal.


Fuente:

Martin A. Gómez Zuleta MD, Karen E. Torres MSc, Michael T. Falduto PhD, Scott R. Magnuson PhD. Identificación de biomarcadores sanguíneos para la detección de lesiones premalignas y el diagnóstico del cáncer gástrico. Rev Col Gastroenterol vol.32 no.1 Bogotá Jan./Mar. 2017. Disponible en: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-99572017000100002


Sunday, June 3, 2018

Prueba de PCR para cáncer gástrico

Tema: Predisposición genética en la prevalencia del cáncer gástrico.

Objetivo: Investigar la relación entre los polimorfismos de loci de interleuquina-1 (IL-1) y el riesgo de cáncer gástrico.

Muestra biologica: Dos grupos de muestras:

  • Grupo control: biopsias de 84 individuos sin evidencias de cáncer gástrico y con diagnóstico histopatológico de gastritis crónica, por medio de endoscopia superior. 
  • Grupo con CG: 84 biopsias incluidas en parafina de adeno-carcinoma gástrico (ADCG).

Acido nucleico: ADN genómico humano.

Extraccion del ADN: QIA-amp tissue Kit (Qiagen) para el grupo con CG. Wizard Genomic DNA Puriñcation kit (Promega) para el grupo de control.

Gen a amplificar: IL-1B-511, IL-1B+3954 y IL-1RN. (Para los tamaños en pares de bases véase Tabla 1)

Tipo de PCR: PCR-RFLP (Véase Tabla 1.)

Visualizacion: Software Arlequin ver. 2.000.



Fuente:
Miryan Cañas, Yeinmy Morán, María Belén Rivero, Adolfo Bohórquez, Venus Villegas, Yanet Rendón, Eddy Ramírez, Elvis Valderrama, Zuly Briceño & Miguel Ángel Chiurillo. Polimorfismo genético de interleuquina-1: Asociación con cáncer gástrico en la población de alto riesgo del Centroccidente de Venezuela. Rev. méd. Chile v.137 n.1 Santiago ene. 2009. Disponible en: https://scielo.conicyt.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-98872009000100009





Friday, May 25, 2018

Prueba de tamizaje y confirmatoria para cáncer gástrico


Prueba de tamizaje 

 El pepsinógeno I y el II han ido sustituyendo en el Japón al método de tamizaje con fluoroscopia ya que, como ha sido demostrado por varios autores, tiene una tasa de detección de cáncer gástrico de 0,168% comparado con el 0,066% de la fluoroscopia. Un estudio en Colombia se construyó una curva ROC para definir el mejor punto de corte para el pepsinógeno I, encontrándose que el mejor punto era un valor < 150ng/ml con una sensibilidad de 84,3% y una especificidad de 71,3%. Se concluyo que el uso de pepsinógeno I es un buen método para detectar gastritis crónica atrófica y cáncer gástrico, y que se debería asociar la determinación del pepsinógeno II por la alta prevalencia de infección por H. pylori. 

Prueba confirmatoria 

 Una endoscopia superior es el estudio importante que se utiliza para detectar el cáncer de estómago. Durante el estudio, el médico inserta por la garganta un endoscopio. Este instrumento le permite al médico observar el revestimiento del esófago, el estómago y la primera sección del intestino delgado. Si se observan áreas anormales, se pueden tomar biopsias que se envían a un laboratorio, donde se examinan al microscopio para determinar si hay cáncer presente.


Fuentes


Saturday, May 19, 2018

Alteración de la epigenómica en el cáncer gástrico

La epigenética estudia los cambios reversibles y heredables en el genoma de una célula que no afectan las secuencias del ADN codificantes para proteínas.Los principales mecanismos de la epigenética son:
  1. La metilación del ADN (hipo e hipermetilación)
  2. Las modificaciones de histonas y remodelación de la estructura de la cromatina 
  3. Los micro ARNs

La inactivación de genes supresores de tumores por metilación del ADN mejor documentada en cáncer gástrico es el silenciamiento de los genes de reparación hMLH1 y hMSH238. La inactivación de hMLH1 es responsable del desarrollo de la MSI. Esta inactivación conduce a mutaciones en secuencias repetitivas simple dentro de genes críticos parael proceso neoplásico. Por lo tanto, la metilación del ADN juega un papel importante en regular la expresión de genes asociados a desarrollo, diferenciación, envejecimiento y tumorigénesis. Una de las particularidades de esta regulación es su reversibilidad al tratamiento con la droga desmetilante 5-Azacytidina (5AzaC), lo cual abriría la posibilidad a nuevas estrategias terapéuticas.
Metilación del ADN caracterizado por la Incorporación de un grupo metilo (-CH3) en el carbono 5 del anillo de pirimidina de las citosinas. La incorporación de este grupo metilo es realizado por la enzima Di Metil Transferasa (DNMT).

Fuente:

Alejandro Corvalán R. Bases epigenéticas del cáncer gástrico: oportunidades para la búsqueda de nuevos biomarcadores. Rev. méd. Chile vol.141 no.12 Santiago dic. 2013. Disponible en: https://scielo.conicyt.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-98872013001200011

Saturday, May 12, 2018

Alteraciones de la traducción en el cáncer gástrico



Las mutaciones corresponden a alteraciones en la secuencia nucleotídica del ADN,  por cambios de bases, ya sea del mismo tipo: cambio de una purina por una purina o pirimidina por pirimidina, conocidas como transición y transversiones respectivamente, provocando una modificación de la secuencia aminoacídica lo que afecta posteriormente al proceso de traducción genética.
El 30% de los cánceres gástricos presentan mutaciones en TP53. El gen p53 activa la transcripción de la familia de microARNs mir34, pequeñas moléculas de ARN que impiden la traducción de  ARN  mensajeros específicos, importantes para inducir detención en el ciclo celular y apoptosis.

Fuentes:




Saturday, May 5, 2018

Alteraciones de la transcripción en el cáncer gástrico



El cáncer gástrico puede ser como resultado de la alteración de la transcripción. En un estudio realizado en el Hospital de Beijing para estudiar los genes y expresiones que se alteran durante este proceso, se encontraron más de 70 expresiones relacionadas con el cáncer, pero las 10 más afectadas durante la transcripción son:  BRCA1, ARID3A, EHF, SOX10, ZNF263, FOXL1, FEV, GATA3, FOXC1 y FOXD1.
BRCA1 es un importante supresor tumoral, el cual juega un rol esencial en mantener la estabilidad e integridad genómica.
Se especula que ARID3A puede actuar como un oncogén en el desarrollo del cáncer.
Anormalidades de los factores SOX juegan un rol crítico en la formación y desarrollo del cáncer. SOX10 ha sido identificado en los cánceres digestivos como un gen metilado, también exhibe actividad tumor supresora.
La expresión de FOXC1 tiene significancia en el desarrollo, progreso y metástasis de cáncer gástrico, y su sobreexpresión puede servir como un marcador útil al predecir el desenlace de pacientes con cáncer gástrico.  FOXC1 y FOXD1 están elevados en cáncer gástrico comprados con tejidos normales.
La expresión de GATA3 está particularmente elevada en pacientes con cáncer gástrico.

Fuentes:

Xu G, Li K, Zhang N, Zhu B, Feng G. Screening driving transcription factors in the processing of gastric cancer. Gastroenterol Res Pract. Hindawi Publishing Corporation. Volume 2016. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4925953/

Sunday, April 29, 2018

Alteraciones de la replicación en el cáncer gástrico


El desarrollo del cáncer gástrico es un proceso complejo y de varias etapas que implica múltiples alteraciones genéticas y epigenéticas en oncogenes, genes supresores de tumores, genes de reparación del ADN, reguladores del ciclo celular y moléculas de señalización. 

Oncogenes

Los oncogenes regulan la división celular y pueden ser clasificados por su localización en citoplásmicos y nucleares; al ser activados por mutaciones pueden causar cáncer. Actúan con un efecto dominante, ya que con solo una copia del alelo activado ocurre el efecto oncogénico, las alteraciones reportadas en CG son sobreexpresión y amplificación de c-met, K-sam, erbB2 y la activación por mutación de K-ras3. 

Genes supresores de tumores

Los genes que reparan el daño al ADN son responsables de detectar y reparar alteraciones en otros genes, al afectarse su función, se desencadena una acumulación progresiva de mutaciones; la metilación anormal en regiones del ADN (islas CpG) juega un papel crítico en la evolución del cáncer, los genes inactivados y afectados por metilación son: ps2, RARβ y RUNX34.

Fuentes:

  1. Heriberto Torres-Jasso y Josefina Yoali Sánchez-López. Cáncer gástrico: alteraciones genéticas y moleculares Juan. Gaceta Médica de México. 2011; 147: 72-3. Disponible en: https://www.anmm.org.mx/GMM/2011/n1/73_GMM_Vol_147_-_1_2011.pdf
  2. Synapticpg.com [Internet]. Comunicación científica para todos [citado el 25 de abril del 2018]. Disponible en: http://www.synapticpg.com/caest_fisiopatologia.html

Saturday, April 21, 2018

Neoplasia Maligna de Estomago


Una neoplasia maligna es una enfermedad en la cual hay células con características anormales, dichas células se dividen de forma descontrolada, pudiendo invadir otros tejidos diferentes al cual se originaron, esto también se conoce como cáncer.La pared del estómago está compuesta por tres capas de tejido: la mucosa (capa más interna), muscular (capa media) y la serosa (capa externa). El cáncer de estómago se origina en las células que revisten la capa mucosa y se disemina a las capas externas a medida que crece. Tipos de cáncer de estómago: Adenocarcinoma, linfoma, tumores del estroma gastrointestinal, tumores carcinoides, entre otros.

Fuentes:


  1. Cancer,org [Internet]. American Cancer Society [actualizado el 01 de diciembre del 2017; citado el 21 de abril del 2018]. Disponible en: https://www.cancer.org/es/cancer/cancer-de-estomago/acerca/que-es-el-cancer-de-estomago.html#escrito_por
  2. Cancer.gov [Internet]. National Cancer Institute [actualizado el 23 de febrero del 2018; citado el 21 de abril del 2018]. Disponible en: https://www.cancer.gov/espanol/tipos/estomago/paciente/tratamiento-estomago-pdq

Thursday, April 12, 2018

Bienvenida

Bienvenidos a mi blog. Donde abordaremos temas asociados a la asignatura de Biología Molecular. Les presentare contenido científico actualizado, avances, nuevos descubrimientos, entre otras cosas. Para todos aquellos futuros profesionales de la salud y personas interesadas.
Semestre 2018-2018


"Las  áreas más nuevas de la Biología Molecular son justamente las antiguas áreas de la Biología Clásica."
-Sydney Brenner